Em primeiro lugar, a concentração e o modo de aplicação dependerão do local a ser tratado. Cada quantidade definirá o tipo de efeito biológico e o efeito no organismo. Podem ser tratadas patologias inflamatórias, infecciosas e, também, de caráter sanguíneo.
Pode também ser utilizado no tratamento de doenças circulatórias, devido ao estímulo de circulação sanguínea possibilitado pelo ozônio.
Possui propriedades bactericidas e fungicidas, consequentemente, sendo muito utilizada para tratamento de feridas infectadas.
O ozônio medicinal pode ser indicado para diversos tratamentos, entre eles: